河南快3

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                真菌de novo 测序

                产品介绍常见问题经典案例结果展示


                无限未来的创造◢者————真菌々基因组

                真菌基因组研究,是通↘过基因组测序和组装
                获得真菌全基因组序列,并对其进∏行结构和功能研究的方法。依据研究目标所需精细程度的不同,
                我们提供了真菌∏框架图、精细图和作为真菌精细♂图前置的真菌Survey三种不同的解决方案。
                对这些菌株的深入研究,也让我们能够更好的了解和Ψ 利用真菌资源,创造①出更大的价值。

                多样化基因组解决方案

                多平台的选择,不同精细程度的真菌基因组测序方案,适用不同研究背景,
                为您量身定制最适宜的真菌基因组解决方案。

                产品 测序平台 测序策略 组装指标 适用范围 项目周期
                真菌Survey Illumina PE150 350bp文库 ≥ 100X 估算基因组大小
                评估组装难度
                30个自然日
                真菌∏框架图 Illumina PE150 350bp文库 ≥ 100X 大量菌株
                框架测序
                45个自然日
                真菌精细图 PacBio PacBio文库 ≥ 100X
                350bp文库 ≥ 50X
                基因组<100 Mb
                CN50*≥2 Mb;
                基因组≥100 Mb
                CN50*≥500 Kb
                少量个体
                精细组装
                60个自然日

                科学方案设计

                从材料选取,建库测序,到数据分析,
                每一步都需要科学、缜▽密的设计,以保障高质量研究成果。

                信息分析

                分析内容=标准分析+高级分析。
                不同精细程度的真菌基因组信息分析,解密↘真菌的发展历程,探究其潜在价值。

                研究领域 具体内容 作用
                基因组组装 基因ζ 组组装及结果评估 组装获得高质量的基因组序列
                基因组结构研∑究 编码基因预测 多种预测途径获得可靠编码基因信息
                ncRNA预测 预测非编码RNA结构
                重复序列分析 分析基因组重复序列结构
                基因基本▲功能注释 常见功能数据库注释
                (NR、GO、KOG、KEGG 、Pfam 、SwissProt、TCDB、CAZy)
                通过常见权威数据库解释编码基因功能
                菌株致病相关◣研究 病原与宿主互作(PHI)、分泌蛋白、次级代谢产物基因簇、
                细胞色素P450、真菌毒力▓因子(DFVF)
                从胞外分泌、宿主互作等机制解释菌株致病性

                深入到位↑的数据挖掘

                不论是个体深入变异解析,还是群体进←化历史解读,我们都有完备的解决方案,
                为您解决关心的生物学问题。

                研究目标 应用技术 解决问题
                个体深入变异解析 基々因组间共线性分析 基因组一对一共线性比较
                寻找基因∞组间同源序列
                基因组间变异检测 以共线性区域为基础
                全面解析基因组间变异信息
                群体进化历史解读 基因家族构建 基于MCL算法精准聚类☆
                单拷贝基因用于进化分析
                进化树构建 构建菌株间进化关系
                解析菌株起源传播规律

                悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

                真菌基因组测序采◆用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
                诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和※Isilon存储的高效组合,
                实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
                以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

                出色完成每一个⌒项目环节

                诺禾致源微生物客户遍布全球,截止2019年6月,已发表20余篇微生物基因组文章,
                真菌基因组完成样品数超过2,000个,项目合作领域涵盖了动植物致病菌、工业菌、益生菌、环境菌株等广泛领域。
                “科学√的方案设计,严格的质控管理,专业的㊣ 分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
                确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。