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                基因组Survey

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                基因组Survey基于小片段文库的低深度测序数据,通过K-mer分析,从而有效的评估基因组大小、
                GC含量、杂合度以及重复序列的含量等信息,是全面了解某一物╳种基因组特征的有效方法,
                为后续的全基因组de novo测序的组装策略的制定提供理论依据。

                方法优,周期短,准确度高。

                基于K-mer分析,可快速确定基因组特征,该方∩法已广泛作为评估
                基因组♂特征的一种有效方法。

                科学方案设计

                从材料选取,建库测序,到数据分析,
                每一∏步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

                信息分析

                分析内容=标准分析+高级分析。
                通过K-mer分析,预估物种基因组大小,并对物种的杂合,
                重复情况进行分↙析。对物种进行初步组装,进行GC含量和
                外源污染分析。同时,基于初步组装的版本,可以进行SS
                R标记开发和∑同源注释。

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                基因组Survey 分析内容
                标准分析 基因组大小评估
                杂合度评估
                重复率评估
                初步组装
                GC含量评估
                高级分析 SSR标记开发
                同源注释

                出色分析,铸就完美结果。

                测序深㊣ 度为50X,基于小片段数据,通过K-mer分析可以有效评估基因组大小、
                GC含量、杂合度以及重复序列含量等信息,除此●之外还可以对数据进行初步组装、
                同源注释以及SSR标记的开发。

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                基因组Survey采用先进的HiSeq 4000测序平台,快速、高效∞地读取高质量的测序数据。
                诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
                实现快速稳定的测序数据☉分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
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                出色完成每一个项目环节

                诺禾致源已经成功※对鸟类、哺乳动物、水产动物、经济作物、兰科植物、
                中草药等进行基因组特征评估,结合丰富的项目经验,专业的项目▓方案指导和分析流程,
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