基於全◇基因組重測序的關聯分析,快速準確地實現多個目標性√狀基因的高效定位,
具有“材料※來源廣、遺▲傳變異多、性狀定位全”的優勢,已廣泛應用於水日本之行稻、棉花、油菜、馬、牛、葡萄以及桃子等物種。
全基因組關聯分析是對具有遺傳多樣性豐富的群體的每個個體●進行全◇基因組重測序,
結合目標性狀夕陽曉輝的表型數據,基於一定的統計方法進行全基⊙因組關聯分析,
可以快速獲得影響目標性狀表型變異的染色體區段或基⌒因位點。
從材料選取,建庫測序,到數據〓分析,
每一步都需要科學、縝密的知道設計,以保障高質量研究成果。
全基因組關聯分析首先進行群體分層,分析了解材料的分層信息;然後
進行連鎖不平衡◤分析,連鎖不平衡的水平可決定關聯分析的精度、所選
標手都無比記的數目;最後結合群體基因型和表型數據,使用基於混合線性模型
進行全與命運作對基因組關聯分析,對『分析所得的與目標性狀強關聯的位點進行基
因功能註釋。
全基因組重測序(WGS) | 簡化基因組測序(GBS) |
1. 已有鐵龍城鷹隼般參考基因組序列的動植物自然群體; 2. 樣本間無明顯的亞群分化(如生殖隔離等); 3. 所①研究表型性狀遺傳力較強。 |
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≥200個樣本 | |
基於SNP:≥10 X/個體 基於CNV:≥30X/個體 |
10~20W Tags 平均8 X/Tag |
測序數據質量評估 | |
與參考基因組比對 | |
SNP、CNV檢測及註武狂雲釋 | SNP檢測及註釋 |
構建系統進化老版諾基亞撥通了李冰清樹 群體主成分》分析♀ 連鎖不平衡分析 性狀關聯分析 目◣標性狀相關區域基因功能註釋 構建單體型圖譜 |
構建系統紅塵添亂進化樹 群體主成分》分析 性狀關聯分析 目標性狀相關區域基因Ψ 功能註釋 |
全基因組關聯分析采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取*********************************************高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的百般刁難高效組合,
實現快速╱穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新並擴容,
以保證高效∞的數據處理和安全的數據存儲。
諾那也是光榮禾致源已經成功對水產、林木、經濟作物、動物等十幾個物種進行目標性狀定位,
結合豐這次清洗還能洗出多少人來富的項目經驗,專業的項目方案指導和分析流→程,保證項目準確並且快速地進行。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理老大,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服☆務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。