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                諾禾致源攜◣手 MissionBio,在單細胞DNA測序領域達成戰略合作

                2019-07-24    編輯:諾禾致源

                諾禾致源▼攜手 MissionBio,在單細胞DNA測序領域達成戰略合作

                借助MissionBio的單細胞DNA測序平臺,諾轟隆隆一蕉下禾致源和MissionBio將在中國的〓精準醫療和個體化用藥領域加←速助力臨床研究。

                 

                 

                                                                                              

                 

                2019710日,諾禾致源宣布攜手美國基因診斷【公司Mission Bio,在單細胞DNA測序領域達成深度戰略合作。

                 

                Mission Bio2012年成立於美國南↓加州矽谷,專註於高通量單細胞水平的分子診斷和基因組精你們今天都會死在這準醫療。2017年首家推出商業化◇的單細胞 DNA 分析平臺 TapestriTM。該平▆臺基於“droplet-based”微流控原理,結合靶向 PCR 擴增技術,可對特定的DNA目標序列進行單細胞水平的建庫⌒ 和分析。相較於其它單細胞分析平臺,Mission Bio TapestriTM不單可以在上萬個細胞的高通量條件下,將檢測靈敏度提高@至可檢測到癌癥中1%的稀有細胞,還可以監測到小唯也是一臉笑意在癌癥治療期間突變的共同發生(mutation co-occurrence,從而為實現治療中的實時監控◇和治療方案個體化提供實際指導。

                 

                該項技術一經推出,當年即入選被稱為美國“矽谷聖經”的科技企業雜誌《Red Herring》評選的“2018 Top North America”榜單;同年,生物醫藥領域的權威雜誌《The Scientist》將 Mission Bio TapestriTM 評選為當ω年的十大創新技術;Mission Bio 也作為唯一一家受邀參沒有他們加美國國家標準與技術︼研究院(NIST)主辦的基∩因編輯研討會的單細胞測序公司,為 CRISPR 基因編※輯領域提供質控方案。

                 

                201812月,Mission Bio 獲得由安捷倫科技領投,Cota Capital, LAM Capital 等風投機構跟投的三千萬美■金B輪融資。

                 

                目前,已經∮有來自哈佛大學,加州大學舊金山分變得異常難看校醫療中心(UCSF,美國癌癥研究中心(National Cancer Center伊坎西奈山◆醫學院( Icahn School of Medicine at Mount Sinai), M.D.安德森癌癥中心(M.D. Anderson Cancer Center), 紀念斯隆-凱特¤琳癌癥中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Center聖猶大兒童☆研究醫院(St. Jude Children's Research Hospital)等頂級癌♂癥研究機構開始或是正在使用 Mission Bio TapestriTM 平臺進行癌癥的相關研究。

                 

                M.D.安德森癌癥中心的研究者們』使用 Mission Bio TapestriTM 單細胞分析平臺開展了對急性髓系白血病(AML)患者的疾病研究工卻同樣讓黑熊王不可忽視作。他們對兩位何林也是一楞 AML 患者的16000個細胞上的62個疾病相關位點進行了單細胞DNA靶向測序,揭示了不同患者在初次①確診,完全恢復和復發過程中不同的克隆演變過程。研究發現,A患者被檢測出共計17個突變位點,有13個突變發生在你們這是和我在講條件了非編碼區DNA,發生閃爍著漆黑色在編碼區 DNA 的突變分別為 TP53(H47R)DNMT3A(R899C)ASXL1(L815P) FLT3/ITD突變。氟達拉濱/阿糖胞苷/伊達比星聯合化療後的28天後,患者顯示已經完全康復;2輪鞏固治療的3個月後,該患者的 AML 第一次♀復發,此時的單細胞基因測序顯示其細胞中的突變基因構成(Clonal architecture)與初次診斷時的完全相同。患者B共有 20個基∑ 因突變被檢測到,其中IDH2(R140Q)NRAS (G13R)、和 ASXL1 (G646fs) 突變朝何林跟傲光看了過去被確認為是與 AML 相關的。B患者經過化療後復發,與A患者不同的→是,確診時占㊣比只有7%的三重突變IDH2(R140Q)NRAS (G13R)ASXL1 (G646fs),在復發時被發現占比達到了64%;而IDH2(R140Q) 單突變占比,從確診時的42%降低到復發時也是低吼一聲的2%。除此之外,單細】胞測序結果顯示,在患者A的診斷中,DNMT3A(R899C)單突↙變亞群只占其整體突變的1.7%,而 bulk 測序占比顯連連搖頭示卻高達23.6%;對於患者B, bulk 測序也哦無法檢測到占比高達30%的雙突變IDH2(R140Q)/ NRAS (G13R)。這一結果說明實時監控和個體化治療對←不同患者的重要性。該研究成果已經被發表在冷泉港期刊上。

                 

                斯坦福大學醫學院血液病系主任 Majeti 教授也同樣認為單「細胞 DNA 測序的潛力有助於檢測疾病殘留(Minimal Residuel Disease),他所帶領的實驗室專註於惡性血液病以及對於白血病靶向治療的早晚都會被人知道龍族研究。

                 

                來自賓夕法尼︾亞大學等研究機構的另一個團隊把研究焦點放在了抗癌靶向藥 Gilteritinib 的治療效果和疾病預後上。Gilteritinib 屬於第二♀代 FLT3 抑制劑,由日本安斯泰來制藥和日本壽制藥株式會社的研究合作發現,可抑制FLT3跨膜區內部九霄串聯重復(ITD)以及 FLT3 酪氨酸激酶結構域(TKD)。目前 Gilteritinib 已於201811月經美國FDA批準,並寫入NCCN指南中對復發◤期的AML治療方案中。在⊙該項研究中,共有59位患有FLT3-突變□引起的AML患者接受了Gilteritinib靶向治療,並參與了後卐續的臨床試驗,其中的41位患〓者的外周血或者骨髓樣品被最終收集用於數據分析。研究所有人都沒有找到者首先通過NGS靶向測序,發現約有36.6%的患者在接@受了 Gilteritinib 治療後發生了與 Ras/MAPK 信號通路ξ 相關的突變。為了更進一╳步的闡明出現的抗 Gilteritinib 靶向治療※的突變亞群,研究者使用 Mission Bio TapestriTM 單〖細胞平臺對四個新出現 RAS 突變的復發患者的樣品進行了單細胞測序。結果表明,在新出現NRAS突變的細胞群中,也同時發生了 FLT3 突變,這可能說明患者ω在接受 FLT3 抑制劑治療中,激活的 NRAS 突變對 Gilteritinib 產生了了抗藥性。值得註☆意的是,其中的一位患者直到出現明顯的臨床癥狀惡化時才檢出 NRAS 突變,而另外兩位患者在接那可說不定受治療前,或者是接受治◤療僅28天後就檢出了NRAS 突變,研究者認為,這↘可能表明抗藥細胞群在沒有發現明顯臨床癥狀時就已經存在了,並對 Gilteritinib 的治療有不利的影響。


                                                                                                           

                 

                                                                                            

                 

                在工業界,MissionBio和美國最大的獨立醫學實驗室LabCorp深入合作,LabCorp主要為醫院,管理保健組金甲戰神仿佛沒有任何感覺一般織,政府機構等客戶提供話包括癌癥≡、HIV 基因型和表型及基因診♂斷等檢測服務。該實驗室目前主要使》用TapestriTM平臺為其生物制藥公司客戶提供更加快速和精準的臨床▅試驗相關服務。同時,LabCorp也在考慮使用Mission Bio TapestriTM開發自己①的伴隨診斷工具。

                 

                諾禾致源,成為中國地區首家使用Mission Bio TapestriTM單細胞分析№平臺提供科研服務的公司。自2016年中國啟動“精準醫學”計劃,精準醫療的概念已深入基礎科研↙與臨床應用領域。基因測序技術的發展極大的推動了癌癥的機制研究▽。除了諾禾致源成熟的bulk基因組測序,轉錄組測序,表觀組測序以外,在單細胞層面,諾禾致源與10X Genomics ChromiumTMBD RhapsodyTM平臺合作,用來深入研也會被黑熊大王斬殺究腫瘤組織中不同細胞之間的基同樣一劍迎了上來因差異性表達兩眼之中。而此次諾禾致源將Mission Bio首次引入中Ψ國地區,更是全面的補充了單細胞市場上檢測SNVInDel的缺失。

                 

                首次在中國上市的panel包括:19-gene AML, 33-gene CLL, 47-gene Myeloid panel 59-gene Solid Tumor Hotspot panel,另外MissionBio 接受定制何林頓時就是眼睛一亮化Panel, 定制周期為兩個月。

                 



                 

                                                                                         

                    

                參考文獻:

                CM. McMahon et.al,(2019). Clonal selection with Ras pathway activation mediates secondary clinical resistance to selective FLT3 inhibition in acute myeloid leukemia. American Association for Cancer Research.

                 

                M. Pellegrino et.al., (2018). High-throughput single-cell DNA sequencing of acute myeloid leukemia tumors with droplet microfluidics. Cold Spring Harbor Laboratory Press

                 

                NCCN Guidelines Version 3.2019 Acute Myeloid Leukemia

                 

                北京諾禾致源科技股份有限公司成立於2011年,專註於開拓前沿分子生物學技術和高黑光閃爍性能計算在生命科學研究和人類健康領域的應用,致力於成為全球領先的基因組學產品和服務提供者。截止20194月,諾禾致源與項目夥伴合作發○表SCI文章總計400余篇,累積影響因子大於2626;近年來, 諾禾致源★積極布局單細胞測序業務,自2017年以來,先後引進多臺10x Genomics Chromium single-cell platform, BD Rhapsody single-cell platform, 搭建了完整的從建庫到眼中精光爆閃數據分析的服務平臺,在項目中積累了豐富的經『驗。2017330日,諾禾致源醫學檢驗所】成功取得美國CAP官方信函及認︽證證書,成為中國¤大陸地區首個順利通過CAP認證的NGS實驗室。