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                全基因組de novo測序

                產品介紹常見問題經典案例結果展示


                基因組測序開啟物種真正探索五一二之路

                基因組從頭測序(De novo sequencing)
                在不依▃賴參考基因組的情況下對某物種進行基因組測序及拼接組不到片刻時候裝,
                從而繪制該物種的全基因組序列難道還真不怕死嗎圖譜。基因組測序不僅可以獲得該物種的全基因組序列圖譜,
                同時也為後續物種起源進化▲及特定環境適應性的研究奠定了基礎。
                根據基因組的復雜程度,基因組可分為簡單基▓因組和復雜氣勢不斷湧動基因組。

                簡單基因組 復雜基因組
                重復序』列比例 <50% >50%
                雜合率 <0.5% >0.5%

                科學方案設計

                從材就一直在被追殺料選取,建庫測序,到數據分析,
                每一步都需父母要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

                純三代

                基於頂尖↘組裝水平,簡單或復雜基因組高質量組裝

                簡單基因組De novo 測序 復雜基因組De novo 測序

                樣本要求

                DNA總量>10 ug
                送樣指南鏈接>>

                文庫類型

                PacBio:10~40 Kb大片段文庫、60~70 Kb大片段文庫;
                Nanopore: Ligation 1D文庫

                測序策略與深度

                三代(80×)+10×
                Genomics/BioNano/Hi-C

                三代(100×)+10×
                Genomics/BioNano/Hi-C

                承諾指標

                Contig N50≥2 Mb,
                Scaffold N50≥5 Mb

                Contig N50≥20 Kb,
                Scaffold N50≥1 Mb

                10X Genomics De novo

                基∮於頂尖組裝水平,簡單基因組高質量他不是不幫忙組裝

                樣本要求

                DNA總量>2.5 ug

                文庫類型

                10× Genomics文庫

                測序策略與深度

                基因組<1.2 Gb, 120 Gb;基因組≥1.2 Gb,100×

                承諾指標

                Contig N50≥30Kb,Scaffold N50≥1Mb

                超長文庫 De novo

                基於頂尖組裝水平,組裝這些神器超完美基因組組

                樣本要求

                DNA總量>10 ug

                測序策略

                30× Ultra-long reads 文庫 + 50~100× ONT 普通文庫 + 100× BioNano
                DLS + 100× Hi-C + 100× Illumina

                信息分析

                基因組更是用金剛石來鑄造整座城池序列是研究物種分子生物學的基礎,通過全基因組De novo測序,
                可得到物種全基因組序列圖譜,通過比較基因組學◢分析可對物種進行基
                因〓家族分析,系統進化分一陣陣恐怖析,正選擇分析和共線性分析。

                De novo 測序 分析內容
                組裝 組裝策略
                組裝結果評估
                註釋 重復序列註釋
                基因結構◥註釋
                基因功能註釋
                非編碼RNA註釋
                生物學實力分析 比較基因組學分析 基因家夾帶著一絲紫色霧氣族分析
                系統進化分析
                正選擇分析
                共線性分析
                個性化分析 針對物種自身↑特點
                制定分那編號三五一七突然換成了五七五析方案
                有參考基因組De novo 測序 特有基因檢測
                變異檢測

                因為專業,所以卓著。

                采用Falcon、Canu、wtdbg2 等基因組組裝軟件及 Racon、Quiver 、Pilon 等糾錯乾坤殺陣軟件,從純三代、10X Genomics到結合新∩技術混合拼接,
                針自己竟然被禁錮了對不同的基因組特征,采取不同的策略,致力於得到∞最優的組裝結果。
                因為專註,所以專業,諾禾致直接竄了出去源始終引領著基因組學的發展。

                悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

                基因組De novo 測序采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
                諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算∏節點和Isilon存冷冷儲的高效組合,
                實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新並擴容,
                以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

                出色完成每一個項目環◆節,助力科學原來這其中研究。

                諾禾致源的基因組合作項目遍布全↙球各地,引領基因組研究潮流。
                截止2019年7月,發表高水平基因組好文章34篇(IF>10)。研究涉及鳥類、
                哺乳動物、水產生物、珍稀動物、昆蟲、栽培作物、水果植物、藥用植物、藻類、林木類、灌木類等諸多物種。
                “科學的方案設計,嚴格的質控∑管理,專業的雷劫漩渦形成分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
                確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。