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                16S、18S、ITS等擴增子測序

                產品介紹常見問題經典案例結果展示


                16S、18S、ITS等擴增子測序

                產品介紹常見問題經典案例結果展示


                一步到位檢測環境微生物多樣性

                擴增⌒ 子測序是對特定長度的PCR產物或捕獲的片段進行測序,分析序列中的變異。
                16S/18S/ITS等擴增※子測序即通過提取環境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域,
                通過檢測目標區域的序列變異和豐度,以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。
                16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。
                ITS分↑為兩個區域:ITS1位於真核生物rDNA序列18S和5.8S之間,ITS2位於5.8S和28S之間。

                讀長長, 周期短, 性價比高。

                采用 Ion S5 XL 測序平鰻鯊銀角肯定會蛻變臺和 NovaSeq 6000 測序平臺。NovaSeq 6000 測序平臺通量更高,速度更快,運行時間更短,周期最短可⌒達10天。Ion S5 XL測序平臺單端測序,無需拼接,SE400/SE600 兩種模式。兩種平臺,為擴增子測序提供更多的選擇。

                科學方案設」計

                從材料選取,建庫測序,到數據分析,
                每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

                信息分析

                分析內容=標準分析+高級分析。
                基於目標區域的◤測序,檢測序列豐度,以充分研究環境微生物多樣性和
                群落隨時都可能給致命一擊結構差異性。

                高級分析 解決問題
                腸型分析 腸道菌準確定位和疾病預測和治療
                貝葉斯速度朝言無行斬去網絡圖 判斷微⊙生物之間、微生物和環境、
                代謝物間□的依賴關系
                Source Tracker 樣本中微⊙生物群落來源
                標準分析 解決問題
                物種註釋 物種註釋及各物種豐度信息
                α-多樣性分析 微生物群落的豐富度和多樣性
                β-多樣性分析 不①同樣本間的微生物群落
                及各樣本差異情況
                多元統計分析 尋找組間具有顯著差異左眼的物種,
                同時可以比較組內差異和組間差異
                的大小,判斷分組是否有意義
                CCA分析 研究物種組成與環境因子間的關♀系
                環境因子關聯分析
                VPA分析
                功能預測 預測樣本的功能組成

                擴◣增子測序解密環境微生物多樣性

                諾禾致源基於多樣性的測序區域選擇,結合研究目的和樣品自東西身的特點,
                靈活制定研究方案,用專業成熟的樣本
                制備、建庫以及數據分析流程,客觀還原樣品本身的菌∴群結構以及豐度。

                悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

                擴增子測還整天到處吹噓序采用先進的Ion S5 XL測序平臺和NovaSeq 6000測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
                諾禾致源〖高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算≡節點和Isilon存儲的高效組合,
                實現快速穩定的測序數『據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新並擴容,
                以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

                項目經驗豐富

                至2017年12月,諾禾致源諾禾16S樣本⌒ 數突破220,000例,
                包括土壤、水體、糞便、淤泥、發酵物等樣本。
                “科學的方案設計,嚴格的質控管理靜靜,專業的分析團隊,豐定風珠富的項目經驗,優質的項目服☆務”
                確保每一個環節都能出色完成,助力▼科學研究。